De nouvelles preuves montrent que COVID-19 était aux États-Unis quelques semaines avant la pensée -Ecologie, science



jeans les premiers jours de la pandémie de COVID-19 aux États-Unis, les autorités ont concentré une capacité de test limitée sur les personnes symptomatiques qui avaient récemment voyagé ou étaient en contact étroit avec une personne qui avait voyagé dans des endroits où des épidémies confirmées de SRAS-CoV-2 ont été observées. Un an plus tard, il est clair qu’une certaine proportion de la transmission virale, peut-être aussi élevée que 50 pourcent— provient d’individus présymptomatiques ou asymptomatiques, ce qui rend difficile la traçabilité de la transmission. Dans une étude publiée dans Maladies infectieuses cliniques Le 15 juin, des chercheurs ont analysé du sang prélevé entre le 2 janvier et le 18 mars 2020 et ont trouvé des anticorps contre le SRAS-CoV-2 dans des échantillons de neuf personnes dans cinq États américains, ce qui signifie que le virus était probablement présent aux États-Unis fin 2019.

«Nous soupçonnions qu’il y avait probablement des cas qui ont précédé ceux qui ont été diagnostiqués et confirmés. Cela suggère fortement qu’il y a eu probablement de multiples expositions avant ces cas initiaux », explique Ashley St. John, chercheuse en maladies infectieuses à la Duke-NUS Medical School de Singapour qui n’a pas participé à l’étude. Les résultats indiquent également « que nous pouvons probablement utiliser la sérologie pour trouver des expositions potentiellement encore plus précoces d’une manière similaire ».

En 2018, des chercheurs des National Institutes of Health et leurs collaborateurs à travers les États-Unis ont commencé à recruter des volontaires pour le programme de recherche All of Us, dont le but est de collecter des données de santé individualisées auprès de nombreuses personnes sur de nombreuses années dans le but ultime de faire médecine plus individualisée. L’étude était donc en train de marcher, rassemblant les antécédents médicaux et les échantillons de sang des participants à travers les États-Unis au début de 2020 lorsque le SRAS-CoV-2 est apparu.

Alors que les fermetures de santé publique commençaient et que le recrutement et les tests pour les études longitudinales s’arrêtaient, Keri Althoff, épidémiologiste à la Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health, et ses collègues de l’équipe All of Us se sont demandé s’ils pouvaient examiner des échantillons précédemment collectés pour voir s’il y avait ou non des anticorps qui cibleraient le SRAS-CoV-2. Cette ligne d’enquête pourrait « nous aider à reconstituer le puzzle des premiers jours, car cela peut nous aider à comprendre où nous pouvons nous améliorer pour nous préparer aux futures épidémies », dit-elle.

Des chercheurs de tout le pays développaient simultanément des tests pour détecter ces anticorps. L’équipe All of Us a donc créé un partenariat avec un groupe de Quest Diagnostics et envoyé des échantillons à leur laboratoire clinique pour des tests d’anticorps. Ils ont demandé deux tests pour chaque échantillon : un pour les anticorps qui ciblent la protéine qui entoure le génome du SRAS-CoV-2 et un pour les anticorps qui ciblent la protéine de pointe virale. Sur les 24 079 personnes qui ont fait des prélèvements sanguins entre le 2 janvier et le 18 mars 2020, 147 étaient positives aux anticorps dirigés contre la nucléocapside. Seuls neuf participants ont été testés positifs pour les anticorps sur les deux tests.

Le premier échantillon positif – provenant d’un participant de l’Illinois prélevé le 7 janvier – a été collecté plus de deux semaines avant le premier rapport de cas officiel dans l’État le 24 janvier. Les chercheurs ont également trouvé des anticorps anti-SRAS-CoV-2 chez des personnes du Massachusetts, Wisconsin. , Pennsylvanie et Mississippi dans des échantillons collectés avant que ces États n’aient des cas officiels.

« En moyenne, il faut environ deux semaines pour [immunoglobulin G] les anticorps soient détectables. . . alors maintenant, nous parlons d’une infection potentielle le 24 décembre ou même avant cela », explique Althoff. Elle ajoute que les résultats corroborent et prolongent les conclusions d’une étude de novembre 2020 menée par des chercheurs des Centers for Disease Control qui a trouvé des anticorps SARS-CoV-2 dans le sang prélevé sur des donneurs en décembre 2019 et janvier 2020 en Californie, Connecticut, Iowa, Massachusetts. , Michigan, Oregon, Rhode Island, Washington et Wisconsin.

« Qu’il y ait eu des cas de COVID-19 avant les cas documentés [is] une conclusion raisonnable, basée sur le fait qu’il est peu probable que nous ayons attrapé le tout premier cas dans bon nombre de ces endroits », a déclaré Saahir Khan, clinicien-chercheur à l’Université de Californie à Irvine, qui n’a pas participé aux travaux. Parce que les auteurs ont trouvé un très petit nombre d’individus positifs aux anticorps dans cet échantillon relativement important qu’ils ont testé, ajoute-t-il, il est possible que le nombre de positifs aux anticorps qu’ils ont détectés ici ne soient pas de vrais positifs.

« Lorsque vous vous trouvez dans une situation où la prévalence est très faible, les faux positifs sont quelque chose avec lequel vous vous débattez », reconnaît Althoff, mais la stratégie de test séquentiel de deux positifs, la quantification ultérieure des anticorps dans ces échantillons et les modèles de simulation qui les chercheurs ont couru pour prédire l’utilisation des soins de santé, les cas et les décès indiquent tous qu’il est très peu probable que les résultats soient dus à une erreur.

D’autres sources de preuves qu’ils pourraient poursuivre à l’avenir, selon St. John, sont les tests de neutralisation, dans lesquels les chercheurs mélangent du sérum positif aux anticorps ou des anticorps isolés d’échantillons de sang avec un virus vivant et voient ce qui se passe. En l’état, les résultats sont « très fortement suggestifs, mais un test de neutralisation aurait vraiment scellé l’affaire pour moi », dit-elle.

Quant à la signification des résultats pour les origines du SRAS-CoV-2 aux États-Unis, « il est important de se rappeler qu’il s’agit d’un très petit échantillon de ce qui se passe dans le pays à cette époque », explique St. John. « Cela pourrait être beaucoup plus d’infections que prévu », ajoute-t-elle. « C’est en quelque sorte un signal d’alarme que nous devons améliorer notre surveillance pour la détection de ces types de maladies infectieuses émergentes, afin que nous puissions attraper plus de cas précoces, car cela souligne vraiment que nous avons une petite vue de ce que arrivait. »

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